26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2856 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2856  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2777  hypothetical protein  53.51 
 
 		 136 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0590  hypothetical protein  52.25 
 
 		 127 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2813  XRE family transcriptional regulator  51.4 
 
 		 126 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  45.13 
 
 		 126 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0107  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.28143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1322  hypothetical protein  46.61 
 
 		 129 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1219  hypothetical protein  46.3 
 
 		 129 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126149  normal  0.0261172 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0346  XRE family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 125 aa  92  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0639  hypothetical protein  41.44 
 
 		 127 aa  85.1  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0368  hypothetical protein  40.74 
 
 		 132 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4130  hypothetical protein  45.37 
 
 		 145 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000962953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3225  hypothetical protein  36.75 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  31.25 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3335  XRE family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00388895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7304  hypothetical protein  44.34 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271584 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1343  hypothetical protein  36.21 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.929082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2931  hypothetical protein  37.93 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2091  hypothetical protein  37.04 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1958  hypothetical protein  34.91 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1717  hypothetical protein  36.11 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4354  hypothetical protein  38.78 
 
 		 122 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00239185  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  42.86 
 
 		 1868 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51020  hypothetical protein  35.11 
 
 		 95 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127493  hitchhiker  0.000000230251 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  31.68 
 
 		 153 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0746  hypothetical protein  35.71 
 
 		 396 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>