27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4354 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4354  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00239185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51020  hypothetical protein  93.68 
 
 		 95 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127493  hitchhiker  0.000000230251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3335  XRE family transcriptional regulator  72.36 
 
 		 123 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00388895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2931  hypothetical protein  52.46 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1717  hypothetical protein  53.23 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2091  hypothetical protein  50.82 
 
 		 119 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1343  hypothetical protein  41.94 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.929082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4130  hypothetical protein  47.41 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000962953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0368  hypothetical protein  43.36 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0639  hypothetical protein  39.5 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0107  hypothetical protein  41.27 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.28143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1219  hypothetical protein  39.66 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126149  normal  0.0261172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  41.59 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2813  XRE family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2777  hypothetical protein  36.21 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0590  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2856  hypothetical protein  39.66 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3225  hypothetical protein  38.14 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  36.22 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1322  hypothetical protein  36.21 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7304  hypothetical protein  36.75 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271584 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0346  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1958  hypothetical protein  36.94 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  31.78 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  29.63 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03824  hypothetical protein  24.3 
 
 		 211 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>