24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3335 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3335  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00388895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4354  hypothetical protein  72.36 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00239185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51020  hypothetical protein  77.08 
 
 		 95 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127493  hitchhiker  0.000000230251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2091  hypothetical protein  53.66 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1717  hypothetical protein  49.6 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1343  hypothetical protein  45.9 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.929082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2931  hypothetical protein  47.15 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4130  hypothetical protein  43.97 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000962953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0590  hypothetical protein  41.07 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0368  hypothetical protein  36.44 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2777  hypothetical protein  38.39 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2813  XRE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0639  hypothetical protein  34.43 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1219  hypothetical protein  34.75 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126149  normal  0.0261172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  36.51 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0107  hypothetical protein  36.51 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.28143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2856  hypothetical protein  39.81 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1322  hypothetical protein  34.48 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3225  hypothetical protein  35.59 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0346  XRE family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  35.11 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7304  hypothetical protein  35.04 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1958  hypothetical protein  33.04 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.571583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>