23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7304 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7304  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1322  hypothetical protein  56.1 
 
 
129 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1219  hypothetical protein  57.76 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126149  normal  0.0261172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2813  XRE family transcriptional regulator  53.51 
 
 
126 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0346  XRE family transcriptional regulator  50.44 
 
 
125 aa  110  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  50.78 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0590  hypothetical protein  53.64 
 
 
127 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0107  hypothetical protein  56.25 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.28143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0368  hypothetical protein  51.85 
 
 
132 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3225  hypothetical protein  46.77 
 
 
128 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2777  hypothetical protein  46.03 
 
 
136 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4130  hypothetical protein  43.97 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000962953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0639  hypothetical protein  48.25 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1958  hypothetical protein  45.05 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432295  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  36.8 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2856  hypothetical protein  44.34 
 
 
227 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2931  hypothetical protein  36.75 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2091  hypothetical protein  38.14 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3335  XRE family transcriptional regulator  35.04 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00388895  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1343  hypothetical protein  39.82 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.929082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1717  hypothetical protein  35.65 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4354  hypothetical protein  37 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00239185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51020  hypothetical protein  36.73 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127493  hitchhiker  0.000000230251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>