26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1322 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1322  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  261  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1219  hypothetical protein  86.05 
 
 
129 aa  226  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126149  normal  0.0261172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2813  XRE family transcriptional regulator  54.87 
 
 
126 aa  136  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7304  hypothetical protein  56.1 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271584 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0346  XRE family transcriptional regulator  51.35 
 
 
125 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0107  hypothetical protein  49.19 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.28143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0590  hypothetical protein  54.05 
 
 
127 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  54.13 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2777  hypothetical protein  54.05 
 
 
136 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0639  hypothetical protein  49.61 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0368  hypothetical protein  51.75 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4130  hypothetical protein  45.76 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000962953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3225  hypothetical protein  45.45 
 
 
128 aa  104  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1958  hypothetical protein  40.98 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432295  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2856  hypothetical protein  46.61 
 
 
227 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  36.07 
 
 
127 aa  84  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1343  hypothetical protein  41.09 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.929082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1717  hypothetical protein  37.93 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2931  hypothetical protein  36.21 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3335  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00388895  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2091  hypothetical protein  35.9 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4354  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00239185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51020  hypothetical protein  32.99 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127493  hitchhiker  0.000000230251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  29.7 
 
 
159 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2873  hypothetical protein  32.61 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03824  hypothetical protein  24.3 
 
 
211 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>