13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03824 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03824  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  441  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2931  hypothetical protein  32.41 
 
 		 120 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0346  XRE family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 125 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4130  hypothetical protein  27.83 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000962953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1717  hypothetical protein  27.52 
 
 		 121 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3225  hypothetical protein  24.51 
 
 		 128 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0368  hypothetical protein  26.36 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0639  hypothetical protein  26.8 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1343  hypothetical protein  24.3 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.929082  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0107  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.28143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  29.63 
 
 		 127 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  27.36 
 
 		 126 aa  42.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1322  hypothetical protein  24.3 
 
 		 129 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>