30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2246 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  256  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0107  hypothetical protein  75.4 
 
 		 126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.28143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0590  hypothetical protein  68.97 
 
 		 127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2777  hypothetical protein  62.93 
 
 		 136 aa  151  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2813  XRE family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0346  XRE family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1219  hypothetical protein  55.05 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126149  normal  0.0261172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1322  hypothetical protein  54.13 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3225  hypothetical protein  45.54 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7304  hypothetical protein  50.78 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0639  hypothetical protein  49.11 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0368  hypothetical protein  50.44 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  43.1 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2856  hypothetical protein  45.13 
 
 		 227 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1958  hypothetical protein  45.54 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4130  hypothetical protein  40.71 
 
 		 145 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000962953 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2931  hypothetical protein  43.36 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1343  hypothetical protein  36.8 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.929082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2091  hypothetical protein  37.9 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3335  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00388895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1717  hypothetical protein  38.39 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4354  hypothetical protein  41 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00239185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51020  hypothetical protein  39.8 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127493  hitchhiker  0.000000230251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  31.36 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  31.82 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  26.42 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  27.87 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  34.88 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03824  hypothetical protein  27.36 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  27.27 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.532676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>