23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51020 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_51020  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  191  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127493  hitchhiker  0.000000230251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4354  hypothetical protein  93.68 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00239185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3335  XRE family transcriptional regulator  77.08 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00388895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2931  hypothetical protein  54.74 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1343  hypothetical protein  45.26 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.929082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2091  hypothetical protein  53.68 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1717  hypothetical protein  50.53 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4130  hypothetical protein  43.3 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000962953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0368  hypothetical protein  39.58 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0107  hypothetical protein  41.84 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.28143  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  39.8 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0590  hypothetical protein  36.73 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2777  hypothetical protein  38.3 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0639  hypothetical protein  35.05 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1219  hypothetical protein  37.11 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126149  normal  0.0261172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3225  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1958  hypothetical protein  37.11 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7304  hypothetical protein  36.73 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  36.17 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2813  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1322  hypothetical protein  32.99 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2856  hypothetical protein  35.11 
 
 		 227 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0346  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>