41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2714 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  267  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  61.11 
 
 
179 aa  168  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  57.14 
 
 
131 aa  156  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  57.98 
 
 
131 aa  155  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  56.41 
 
 
132 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  48.31 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  47.93 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  47.06 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  36.44 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  36.7 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  36.7 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2862  hypothetical protein  31.53 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.927887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  38.24 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  31.86 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  29.41 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  30.89 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  27.73 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  31.2 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  33.02 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  31.07 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  28.46 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  30.51 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  30.51 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  30 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  30.89 
 
 
127 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  29.25 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  29.25 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  23.58 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  28.7 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  29.91 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  29.63 
 
 
174 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  29.63 
 
 
173 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  30.19 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  29.91 
 
 
222 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  29.91 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  29.91 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  29.91 
 
 
307 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  32.08 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  27.27 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  29.25 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>