52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1494 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  383  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  71.03 
 
 		 145 aa  207  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  69.66 
 
 		 145 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  81.67 
 
 		 139 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  81.67 
 
 		 139 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  81.67 
 
 		 139 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  81.67 
 
 		 139 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  81.67 
 
 		 139 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  81.67 
 
 		 139 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  80 
 
 		 144 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  71.85 
 
 		 222 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  71.85 
 
 		 139 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  71.85 
 
 		 139 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  71.85 
 
 		 307 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  71.54 
 
 		 145 aa  191  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  53.28 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  57.26 
 
 		 127 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  55.65 
 
 		 128 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  51.79 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  50.88 
 
 		 129 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  47.01 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  45.67 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  46.28 
 
 		 158 aa  99  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  46.28 
 
 		 158 aa  99  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  43.36 
 
 		 125 aa  98.6  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  43.28 
 
 		 137 aa  98.2  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  40.4 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  42.64 
 
 		 152 aa  95.5  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  39.39 
 
 		 148 aa  94.4  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  42.15 
 
 		 175 aa  91.7  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  41.59 
 
 		 136 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  40.65 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  43.12 
 
 		 138 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  43.12 
 
 		 138 aa  88.2  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  38.14 
 
 		 146 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  34.51 
 
 		 148 aa  85.5  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  36.94 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  31.79 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  36.94 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  37.29 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1187  hypothetical protein  41 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  30.28 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  29.73 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  33.57 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  31.62 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  35.24 
 
 		 131 aa  48.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  33.65 
 
 		 137 aa  47.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  32.46 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  29.91 
 
 		 129 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  32.08 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  32.67 
 
 		 132 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>