53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2470 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  96.4 
 
 
307 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  83.45 
 
 
139 aa  238  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  82.73 
 
 
139 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  82.73 
 
 
139 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  82.01 
 
 
139 aa  233  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  82.01 
 
 
139 aa  233  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  82.01 
 
 
139 aa  233  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  81.29 
 
 
144 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  77.21 
 
 
145 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  77.21 
 
 
145 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  81.4 
 
 
145 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  71.85 
 
 
188 aa  193  7e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  50.77 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  50.42 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  53.91 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  113  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  45.97 
 
 
129 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  42.75 
 
 
137 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  42.45 
 
 
152 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  42.97 
 
 
129 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  43.65 
 
 
158 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  43.65 
 
 
158 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  39.82 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  42.45 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  37.1 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  41.73 
 
 
138 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  37.96 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  38.89 
 
 
174 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  39.17 
 
 
148 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  39.84 
 
 
175 aa  90.1  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  38.13 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  39.02 
 
 
173 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  35.25 
 
 
148 aa  87  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  38.1 
 
 
174 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  38.66 
 
 
151 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  36.04 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  36.04 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  35.83 
 
 
277 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1187  hypothetical protein  38.18 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  27.93 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  39.81 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  37.5 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  29.17 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  34.51 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  31.9 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  34.58 
 
 
131 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3810  hypothetical protein  22.22 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  29.91 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2896  hypothetical protein  24.14 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4317  hypothetical protein  24.56 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>