55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0436 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  67.88 
 
 		 137 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  57.97 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  60.14 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  59.42 
 
 		 138 aa  146  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  50.36 
 
 		 136 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  45.6 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  43.28 
 
 		 188 aa  98.2  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  45.97 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  44.8 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  43.07 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  43.07 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  42.4 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  44.92 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  40.88 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  40.88 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  40.88 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  38.13 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  38.13 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  38.13 
 
 		 222 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  43.22 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  38.89 
 
 		 307 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  37.19 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  47.52 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  35.83 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  34.51 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  34.51 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  30.97 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  34.31 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  35.83 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  35.83 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  32.43 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  32.23 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  31.03 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  31.93 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  35.65 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  33.07 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  33.62 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  30.95 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  33.62 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2862  hypothetical protein  32.77 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.927887  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  31.11 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  30.17 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  32.52 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  30.37 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  30.51 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  31.03 
 
 		 277 aa  53.9  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2896  hypothetical protein  30.56 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4317  hypothetical protein  26.17 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  28.95 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3810  hypothetical protein  25 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>