36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1071 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  65.35 
 
 		 131 aa  177  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  68.38 
 
 		 132 aa  170  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  61.11 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  66.39 
 
 		 131 aa  167  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  46.97 
 
 		 137 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  50.88 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  47.01 
 
 		 135 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  38.79 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2862  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.927887  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  30.09 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  31.3 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  36.73 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  30.17 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  37.74 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  32 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  37.74 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  30.95 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  31.09 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  38.27 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  26.52 
 
 		 129 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  30.63 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  41.79 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  32.43 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  41.79 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  30.63 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  26.26 
 
 		 125 aa  45.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  30.63 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  32.08 
 
 		 188 aa  44.3  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  31.93 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  27.27 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  27.34 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2859  hypothetical protein  31.13 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  32.67 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  31.68 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>