48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1660 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  83.21 
 
 		 137 aa  227  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  74.81 
 
 		 135 aa  204  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  52.07 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  51.18 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  48.03 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  48.31 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  47.01 
 
 		 179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2862  hypothetical protein  46.85 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.927887  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  38.64 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  37.93 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  36.28 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  39.09 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  36.28 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  35.14 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  39.09 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  31.53 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  34.23 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  30.6 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  33.04 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  32.23 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  30.37 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  34.88 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  29.91 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  32.17 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  34.4 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  34.4 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  30.23 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  31.75 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  37.5 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  34.51 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  34.51 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  32.56 
 
 		 307 aa  50.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  31.34 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  31.62 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  30.43 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  25.93 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  30.66 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  30.66 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  31.34 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  29.71 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  31.34 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  31.34 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2859  hypothetical protein  34.29 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3810  hypothetical protein  28.97 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  30.36 
 
 		 148 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3225  hypothetical protein  28.15 
 
 		 128 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  30.19 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>