50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5566 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  94.24 
 
 		 139 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  92.81 
 
 		 139 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  92.81 
 
 		 139 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  92.81 
 
 		 139 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  91.37 
 
 		 144 aa  257  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  82.73 
 
 		 222 aa  239  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  82.73 
 
 		 139 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  82.73 
 
 		 139 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  81.29 
 
 		 307 aa  234  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  79.56 
 
 		 145 aa  221  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  77.54 
 
 		 145 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  82.81 
 
 		 145 aa  215  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  81.67 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  50.41 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  52.14 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  53.03 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  52.68 
 
 		 113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  44.72 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  50.85 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  47.32 
 
 		 129 aa  100  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  41.59 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  47.46 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  43.65 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  43.65 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  48.62 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  43.07 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  47.71 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  38.66 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  38.89 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  38.52 
 
 		 175 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  41.8 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  39.5 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  35 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  38.89 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  35.88 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  38.74 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  38.74 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  36.97 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  42.59 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1187  hypothetical protein  40.91 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  30.63 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  30.08 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  30.66 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  28.68 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  27.13 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3810  hypothetical protein  24.21 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>