53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0634 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  266  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  53.28 
 
 
188 aa  135  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  49.59 
 
 
145 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  47.06 
 
 
145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  50.42 
 
 
222 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  50.42 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  50.42 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  50.42 
 
 
307 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  50.41 
 
 
139 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  50.41 
 
 
139 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  50.41 
 
 
139 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  50.41 
 
 
139 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  50.41 
 
 
139 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  50.41 
 
 
139 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  47.93 
 
 
145 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  50.41 
 
 
144 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  44.19 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  41.67 
 
 
129 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  44.64 
 
 
113 aa  94.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  40.91 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  37.29 
 
 
148 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  41.38 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  41.38 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  39.82 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  36.28 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  33.05 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  33.05 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  54.67 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  54.67 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  38.79 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  35.9 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  35.14 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  34.71 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  33.9 
 
 
277 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  34.23 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  36.36 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  32.76 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  32.48 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  32.23 
 
 
174 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  33.86 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  31.15 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  31.34 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1187  hypothetical protein  31.25 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  31.2 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  32.23 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  31.36 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  31.09 
 
 
179 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  30.08 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  34.44 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  32.43 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2896  hypothetical protein  28.44 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>