49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3684 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  97.12 
 
 		 139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  93.53 
 
 		 144 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  92.81 
 
 		 139 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  92.81 
 
 		 139 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  82.01 
 
 		 222 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  82.01 
 
 		 139 aa  233  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  82.01 
 
 		 139 aa  233  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  81.29 
 
 		 307 aa  230  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  82.26 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  75.36 
 
 		 145 aa  215  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  84.68 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  81.67 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  52.99 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  50.41 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  57.39 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  52.68 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  45.65 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  44.53 
 
 		 129 aa  103  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  45.38 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  41.59 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  47.9 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  38.3 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  47.71 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  46.79 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  38.97 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  40.88 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  38.1 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  41.8 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  39.06 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  38.66 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  35.83 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  38.89 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  37.84 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  37.84 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  36.13 
 
 		 277 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1187  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  29.73 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  29.27 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  36.54 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  31.34 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3810  hypothetical protein  22.52 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  32.38 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>