49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3925 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  66.22 
 
 		 148 aa  205  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  48.31 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  40.16 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  39.83 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  36.69 
 
 		 307 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  38.1 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  37.1 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  37.1 
 
 		 222 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  37.1 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  38.3 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  38.3 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  38.3 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  37.7 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  38.66 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  38.66 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  37.59 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  34.93 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  38.14 
 
 		 188 aa  87.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  39.58 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  40.28 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  40.28 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  34.71 
 
 		 277 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  36.51 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  33.05 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  41.28 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1187  hypothetical protein  34.96 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  37.07 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  31.75 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  37.72 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  35.4 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  33.63 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  33.63 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  30.95 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  30.95 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  31.58 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  35.65 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  32.54 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  33.64 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  33.64 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  27.35 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  29.08 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  25.89 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  32.41 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  32.43 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  32.69 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  29.09 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>