39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2226 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  272  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  75.78 
 
 		 131 aa  214  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  76.56 
 
 		 131 aa  213  5e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  68.38 
 
 		 179 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  56.41 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  56.03 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  52.07 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  52.59 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2862  hypothetical protein  36.04 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.927887  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  36.44 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  37 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  33.07 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  33.9 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  36.79 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  36.79 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  29.41 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  35.09 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  31.36 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  28.32 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  31.63 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  34.86 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  34.86 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  31.15 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  27.64 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  28.93 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  29.69 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  32.41 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2859  hypothetical protein  29.46 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  37.7 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  31.68 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  32.67 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  32.67 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  32.67 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2896  hypothetical protein  32.26 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  27.83 
 
 		 158 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  27.73 
 
 		 175 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  27.83 
 
 		 158 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>