14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2859 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2859  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  226  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  34.29 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  32.73 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  35.24 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2862  hypothetical protein  35.56 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.927887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  32.46 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  32.38 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  28.95 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  28.07 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  31.78 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2896  hypothetical protein  28.57 
 
 
124 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3810  hypothetical protein  26.74 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  30.3 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>