52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2010 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  267  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  86.26 
 
 
131 aa  239  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  75.78 
 
 
132 aa  214  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  65.35 
 
 
179 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  57.14 
 
 
129 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  48.03 
 
 
135 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  48.78 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  48.12 
 
 
135 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  37.29 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  36.54 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  36.7 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  31.93 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2862  hypothetical protein  31.82 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.927887  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  37.61 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  30.77 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  31.34 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  31.45 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  35.96 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  31.19 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  33.63 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  35.19 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  28.83 
 
 
129 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  35.19 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  29.37 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  28.04 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  31.37 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  29.75 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  33.96 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2859  hypothetical protein  30.48 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  32.43 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2804  hypothetical protein  33.66 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0781279  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  32.46 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  31.9 
 
 
222 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  34.86 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  32.46 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  31.9 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  31.9 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  30.47 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  30.7 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  29.37 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  28.07 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  27.13 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  28.95 
 
 
144 aa  42  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  29.46 
 
 
277 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  27.13 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  28.57 
 
 
148 aa  42  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  29.06 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2896  hypothetical protein  30.21 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0590  hypothetical protein  24.43 
 
 
127 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>