33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2896 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2896  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  258  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3810  hypothetical protein  43.24 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4317  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  38.79 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  55.81 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  32.43 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  30.43 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  30.56 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  27.55 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  29.31 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  29.52 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  29.52 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  24.11 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  30.23 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  30.23 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  24.11 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  26.17 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  27.1 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  27.19 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  28.44 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  27.19 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  27.54 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  24.14 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  24.14 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  24.14 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  30.21 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  32.26 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  25.23 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  23.28 
 
 		 307 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>