22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2862 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2862  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  283  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.927887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  48.18 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  47.27 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  46.85 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  36.04 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  36.04 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  38.46 
 
 
179 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  31.53 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  31.82 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  32.77 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  31.09 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  29.46 
 
 
277 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  33.65 
 
 
138 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  31.25 
 
 
148 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  36.45 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  28.93 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  28.46 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2859  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  30.84 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  28.16 
 
 
124 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  28.16 
 
 
124 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  28.46 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>