36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1187 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1187  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  279  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  60.16 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  52.8 
 
 		 277 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  34.96 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  34.53 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  41 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  40.91 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  40.91 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  40.91 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  41.84 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  38.18 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  38.18 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  38.18 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  31.25 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  33.04 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  38.53 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  35.19 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  36.27 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  36.27 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  32.43 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  35.24 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  32.76 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  35.58 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  31.36 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  32.76 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  32.2 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  34.34 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  30.51 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  32 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  32 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  30.84 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>