78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3315 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  32.43 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  39.5 
 
 		 138 aa  87.8  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  34.92 
 
 		 142 aa  84  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  84  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  31.13 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  31.69 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  34.68 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  29.51 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  34.82 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  37.1 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  34.68 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  27.69 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  28.69 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  33.06 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  32.79 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  27.87 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  34.95 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  30.63 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  27.05 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  28.24 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  27.89 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  31.09 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  27.43 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  27.43 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  35.16 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  36.05 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  31.07 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  27.12 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  28.32 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  28.79 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  24.79 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  26.97 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  30.23 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  26.23 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  36.84 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  26.15 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  24.81 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  28.07 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  27.97 
 
 		 191 aa  47.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  25.64 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  26.92 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  26.67 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  26.79 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  26.09 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  26.79 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  27.72 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  27.05 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  24.27 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2777  hypothetical protein  29.09 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4354  hypothetical protein  30.93 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00239185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  31.82 
 
 		 107 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  34 
 
 		 109 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  24.06 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  25.78 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  30.23 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  32.73 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0873  hypothetical protein  47.37 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5599  putative transcriptional regulatory protein  28.16 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  27.47 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5411  putative transcriptional regulatory protein  28.16 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.928182 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4901  hypothetical protein  25.53 
 
 		 107 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  42.11 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  22.56 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12021  transcriptional regulator  28 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3123  hypothetical protein  27.16 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  22.3 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>