31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6756 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  340  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  45.7 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  45.19 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  45.58 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  40.13 
 
 		 191 aa  124  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2596  hypothetical protein  52.69 
 
 		 95 aa  107  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292698  normal  0.0948228 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  37.04 
 
 		 190 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6546  hypothetical protein  47.76 
 
 		 91 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3876  hypothetical protein  45.16 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5296  hypothetical protein  49.23 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5563  hypothetical protein  49.23 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  27.27 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  23.85 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1181  hypothetical protein  58.33 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.120079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  22.31 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  26.42 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  27.33 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  27.94 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  19.53 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3894  hypothetical protein  25.81 
 
 		 152 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  29.71 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  17.97 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  24.06 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  43.59 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  30.5 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  27.2 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  28.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  27.27 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  28.42 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>