14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1181 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1181  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  173  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.120079  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  43.28 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  48.33 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3876  hypothetical protein  37.21 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  38.16 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  58.33 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  41.67 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6546  hypothetical protein  35.14 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5563  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2596  hypothetical protein  47.06 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292698  normal  0.0948228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  45.83 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  34.33 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  44.74 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>