48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4212 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  263  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  33.82 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  36.84 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  40.58 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2438  prevent-host-death family protein  30.67 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0146525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  40.58 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  40.58 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  41.07 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4184  hypothetical protein  38.78 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  34.33 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  39.13 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  37.04 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4315  hypothetical protein  35.19 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.135355  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  37.04 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  39.06 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  35.09 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  36.73 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  34.55 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1618  putative stability protein StbD  34.48 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.602129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1656  putative stability protein StbD  34.48 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1722  putative stability protein StbD  34.48 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.139428  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  34.72 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  37.68 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  41.3 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  34.55 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  34.55 
 
 
167 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2257  prevent-host-death family protein  47.37 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000344614  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0822  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.556624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  34.55 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  28.38 
 
 
141 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4768  prevent-host-death family protein  44.74 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  47.37 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  35.82 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  36 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1181  hypothetical protein  44.74 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.120079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0154  prevent-host-death protein  39.62 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5383  prevent-host-death family protein  44.74 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.580876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3850  prevent-host-death family protein  40 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000226334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4837  prevent-host-death family protein  44.74 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  37.25 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  37.25 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.382149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>