78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05635 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  94.67 
 
 		 150 aa  294  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  40.82 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  39.46 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  38.26 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  35.34 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  31.08 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  31.08 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  33.04 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  31.08 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  34.78 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  30.41 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  29.91 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  30.97 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  31.36 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  31.36 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  34.78 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  30.65 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  30.65 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  26.96 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  29.84 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  27.59 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  28.32 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  32.91 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  26.72 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  32.76 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  31.71 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  24.43 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  21.37 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  28.75 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  27.84 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  23.64 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  25.38 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  33.77 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  26.36 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  27.38 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  33.77 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  28.75 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  31.58 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3894  hypothetical protein  23.74 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  29.25 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  24.11 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  20.83 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  27.12 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  22.76 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  25.88 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3123  hypothetical protein  29.41 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  26.44 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  37.04 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  27.45 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  28.21 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  17.97 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  23.21 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  29.89 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  26.32 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  23.21 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  25.96 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  23.21 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  25.44 
 
 		 146 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  31.17 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  31.48 
 
 		 109 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  25.49 
 
 		 143 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  20.16 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  25.42 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  19.38 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  25.37 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  17.97 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  31.76 
 
 		 142 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>