35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6457 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  284  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  93.71 
 
 
143 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5423  hypothetical protein  73.43 
 
 
143 aa  216  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  50.36 
 
 
146 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  44.6 
 
 
144 aa  120  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  42.03 
 
 
146 aa  103  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  42.35 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  37.21 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  42.05 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  34.07 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  35.4 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  26.87 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  32.11 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  32.33 
 
 
154 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  29.75 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  32.28 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  24.6 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  33.04 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  30.65 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  31.65 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  28.67 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  27.61 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  28.67 
 
 
145 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  29.37 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  29.37 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  29.37 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  23.31 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  28.7 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  38.1 
 
 
173 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  25.42 
 
 
150 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  25.42 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  35.62 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  27.68 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>