20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5423 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5423  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  287  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  73.43 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  71.33 
 
 		 143 aa  210  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  48.95 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  44.29 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  41.84 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  39.32 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  38.46 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  40.35 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  35.4 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  30.88 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  30.88 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  33.6 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  31.03 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  29.08 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  28.36 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  30.77 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  26.12 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  24.79 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  27.54 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>