67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1038 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  95.3 
 
 		 149 aa  288  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  61.65 
 
 		 150 aa  173  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  40.82 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  38.78 
 
 		 150 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  36.76 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  36.76 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  36.76 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  34.43 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  30.37 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  40.18 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  38.18 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  31.93 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3894  hypothetical protein  27.01 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  30.71 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  33.62 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  33.04 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2238  hypothetical protein  29.69 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000319661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  31.3 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  34.82 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  31.29 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  24.56 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  38.14 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  30.09 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  37.07 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  32.69 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  32.76 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  36.21 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  32.76 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  36.21 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  38.35 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  31.85 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  32.76 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  32.17 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  26.67 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  28.86 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  39.66 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  29.52 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5423  hypothetical protein  30.88 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  23.28 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  28.69 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2069  hypothetical protein  37.14 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.473334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  28.85 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  26.79 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0873  hypothetical protein  34.88 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  31.97 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  34.57 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  33.65 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  28.81 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  32 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  31.52 
 
 		 189 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  23.39 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  30.65 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>