30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6279 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  93.71 
 
 		 143 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5423  hypothetical protein  71.33 
 
 		 143 aa  210  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  51.08 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  46.76 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  43.57 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  38.13 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  38.57 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  36.97 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  31.85 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  32.59 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  26.98 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  33.08 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  26.12 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  30.58 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  32.17 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  30.71 
 
 		 156 aa  48.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  29.82 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  26.87 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  30.4 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  30.83 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  38.1 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  29.5 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  29.37 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  29.37 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  22.56 
 
 		 170 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>