31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4968 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  285  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  46.76 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5423  hypothetical protein  44.29 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  44.6 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  45.16 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  43.65 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  34.97 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  37.07 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  33.6 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  32.87 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  32.86 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  38.35 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  37.29 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  33.75 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  30.7 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  29.58 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  28.26 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  34.23 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  29.41 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  27.93 
 
 		 166 aa  48.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  32.43 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  25.29 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  29.17 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  30.17 
 
 		 138 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  28.91 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  29.69 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>