62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6616 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  313  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  98.68 
 
 
151 aa  297  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  98.68 
 
 
151 aa  297  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  98.68 
 
 
151 aa  297  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  97.35 
 
 
151 aa  295  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  96.69 
 
 
151 aa  292  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  97.35 
 
 
151 aa  291  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  43.08 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  44.53 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  44.53 
 
 
143 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  42.19 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  39.69 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  45 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  39.69 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  47.62 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  40.35 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  45.56 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  36.64 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  38.37 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  39.08 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  36.14 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  37.8 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  29.69 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  34.72 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.84 
 
 
279 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  38.1 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  28.92 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  30.83 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  34.74 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  28.87 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  31.96 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  32.8 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  31.46 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  29.92 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  30.48 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  27.61 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  28.67 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  29.07 
 
 
174 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  35 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  42.11 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  30 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  31.87 
 
 
175 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  28.03 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  29.07 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  30.77 
 
 
162 aa  43.9  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  28.92 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  27.37 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  28.92 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  30.12 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  32 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  23.81 
 
 
166 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  32 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  25.81 
 
 
140 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  43.9 
 
 
189 aa  41.2  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  28.91 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  25 
 
 
167 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>