106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1246 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  65.61 
 
 
201 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  63.27 
 
 
227 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  38.67 
 
 
192 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.34 
 
 
183 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.34 
 
 
181 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  40.78 
 
 
183 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  38.55 
 
 
185 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  39.11 
 
 
183 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  40 
 
 
182 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  37.78 
 
 
180 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  37.78 
 
 
181 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  38.89 
 
 
180 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  39.78 
 
 
183 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  38.67 
 
 
183 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  37.63 
 
 
194 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35.56 
 
 
181 aa  108  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.42 
 
 
180 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.44 
 
 
178 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.5 
 
 
196 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.66 
 
 
188 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  30.77 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  30.77 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.6 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  29.67 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  29.03 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  29.03 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  29.12 
 
 
207 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  29.12 
 
 
207 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  29.12 
 
 
207 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  30.17 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  29.12 
 
 
207 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  53.45 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01810  conserved hypothetical protein  31.54 
 
 
602 aa  65.9  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  26.6 
 
 
207 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  44.62 
 
 
149 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  43.94 
 
 
159 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  28.57 
 
 
207 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  29.41 
 
 
176 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  43.94 
 
 
191 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  29.41 
 
 
176 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  28.26 
 
 
176 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  26.63 
 
 
206 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  27.92 
 
 
204 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  29.73 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  37.84 
 
 
156 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.44 
 
 
595 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  43.33 
 
 
159 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  31.36 
 
 
603 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  29.51 
 
 
584 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  28.32 
 
 
203 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  31.97 
 
 
607 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.27 
 
 
203 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  27.32 
 
 
601 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  37.84 
 
 
151 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  24.03 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.12 
 
 
395 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  30 
 
 
585 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  37.84 
 
 
151 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  37.84 
 
 
151 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  28.9 
 
 
1407 aa  49.3  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  37.84 
 
 
151 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000241  DNA polymerase III alpha subunit  27.23 
 
 
204 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  37.84 
 
 
151 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  37.84 
 
 
151 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  40.68 
 
 
108 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  22.64 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  22.64 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00000352729 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.51 
 
 
398 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  22.08 
 
 
281 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1381  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.26 
 
 
204 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348365  normal  0.0969598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  32.42 
 
 
630 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  26.8 
 
 
1449 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.17 
 
 
383 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  26.8 
 
 
1449 aa  45.4  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  22.01 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  22.01 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  22.01 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.05 
 
 
375 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.05 
 
 
375 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  20.69 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.05 
 
 
375 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  22.01 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.24 
 
 
595 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  31.87 
 
 
630 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  31.87 
 
 
630 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1122  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.63 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.046936  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  27.98 
 
 
379 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  29.51 
 
 
601 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  35.94 
 
 
150 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0016  DNA-directed DNA polymerase  29.08 
 
 
218 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4160  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.08 
 
 
218 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  32.84 
 
 
166 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.52 
 
 
565 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.81 
 
 
610 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3411  DNA-directed DNA polymerase  26.19 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.537666  normal  0.0817359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.7 
 
 
210 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>