67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3735 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  78.62 
 
 		 145 aa  220  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  77.24 
 
 		 145 aa  217  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  74.65 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  42.19 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  42.97 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  42.19 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  42.19 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  42.19 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  40.62 
 
 		 151 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  40.62 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  35.07 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  37.7 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  36.49 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  36.49 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  36.24 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  35.2 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  28.15 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  34.78 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  35.48 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  33.11 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  31.09 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  31.78 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  27.46 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  35.96 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  35.96 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  30.66 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  30.71 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  32.17 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  34.51 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  38.27 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  26.36 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  32.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  27.34 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  38.24 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  26.36 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  30.83 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  28.97 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  27.05 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  35.53 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5423  hypothetical protein  30.77 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  30.39 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  30.95 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  39.29 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  30.95 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  21.94 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  30.95 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  27.94 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  40.32 
 
 		 109 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  26.52 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  31.3 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  34.02 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  40.58 
 
 		 104 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  27.89 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  30.88 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3123  hypothetical protein  34.62 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  36.62 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0873  hypothetical protein  31.25 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>