61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6688 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  98.68 
 
 		 151 aa  299  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  98.68 
 
 		 156 aa  297  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  98.01 
 
 		 151 aa  296  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  98.68 
 
 		 151 aa  295  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  43.08 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  43.75 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  42.19 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  45 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  39.69 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  39.69 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  47.62 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  40.35 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  36.64 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  37.35 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  37.8 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  40.23 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  33.72 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  33.72 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  33.72 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  36.11 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  29.69 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  38.37 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  39.29 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  28.92 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.84 
 
 		 279 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  30.23 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  28.87 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  30.93 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  32.8 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  31.87 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  28.42 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  30.23 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  33.68 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  31.46 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  30.48 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  31.82 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  34.09 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  26.88 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  32.97 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  28.67 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  46.34 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  27.61 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  29.92 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3123  hypothetical protein  29.36 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  30.12 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  28.03 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  24.21 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  32 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  36.23 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  32.5 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  28.92 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  28.92 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>