60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2004 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  34.82 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  29.92 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  30.08 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  32.28 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  30.71 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  36.44 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  32.2 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  27.87 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  31.71 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  26.77 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  32.14 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  30.36 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  30.43 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  30.36 
 
 		 176 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  29.46 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  33.05 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  31.43 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  28.69 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  28.18 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  28.07 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  26.4 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  28.18 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  30.77 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  22.73 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  28.93 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  23.64 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  29.91 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  29.66 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  26.5 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  27.27 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  27.47 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  25.76 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  25.22 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  28.41 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  25.62 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  25.22 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  25.22 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  27.19 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  30.14 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  29.46 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  24.21 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  24.21 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  25.49 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  24.21 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  24.21 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  23.26 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  26.52 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  23.08 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  24.21 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2273  hypothetical protein  37.04 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0784666  hitchhiker  0.00253392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  24.21 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  23.39 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  22.34 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  22.13 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  22.34 
 
 		 145 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>