16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2341 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  292  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  30.08 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  30.63 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  27.27 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  26.97 
 
 
161 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  25.47 
 
 
166 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  26.92 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  31.4 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  24.42 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  25.88 
 
 
173 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  30.48 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  31.43 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  29.52 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  23.42 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  27.78 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  23.02 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>