63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7386 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  43.65 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  41.94 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  33.05 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  31.15 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  34.82 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  34.82 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  32.65 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  32.19 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  31.68 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  31.68 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  31.68 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  30.43 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  38.2 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  36.05 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  39.13 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  31.93 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  37.11 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  27.88 
 
 		 104 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  37.93 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  33.71 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  31.52 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  30.47 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  25.38 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  32.18 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  36.89 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2273  hypothetical protein  43.33 
 
 		 62 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0784666  hitchhiker  0.00253392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  30.47 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  28.05 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  43.02 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  28.75 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  31.46 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  25.2 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  27.87 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  31.46 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  31.46 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  38 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  31.46 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  31.46 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  31.46 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  31.46 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2238  hypothetical protein  32.43 
 
 		 128 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000319661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  38.1 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  29.57 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  36.17 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  25.88 
 
 		 143 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  32.5 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2069  hypothetical protein  27.96 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.473334  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  38.1 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  24.06 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  29.35 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  40 
 
 		 279 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  32.5 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  26.74 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  27.91 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  34.92 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  27.42 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  25.58 
 
 		 145 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  20.13 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  29.52 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>