23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2238 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2238  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000319661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  29.69 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  28.91 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  39.64 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  28.24 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  29.01 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  38.57 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  27.93 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  38.03 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  29.13 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  33.8 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  32.43 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  22.5 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  42.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  29.73 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  29.73 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  25.23 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3894  hypothetical protein  24.62 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  30.63 
 
 		 132 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  28.1 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  28.44 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>