25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3894 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3894  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  46.67 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  33.78 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  33.78 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  33.78 
 
 		 148 aa  97.1  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  34.92 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  27.01 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  25.55 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  32.46 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  26.32 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  25.22 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  24.16 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  25.81 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  23.74 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  26.6 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  24.79 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  27.61 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  26.32 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2238  hypothetical protein  24.62 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000319661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  22.61 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  23.48 
 
 		 159 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  28.21 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  32.1 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  24.6 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  27.35 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>