72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2530 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  298  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  298  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  35.81 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  37.16 
 
 
150 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3894  hypothetical protein  33.78 
 
 
152 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  36.76 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  37.4 
 
 
165 aa  90.5  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  35.62 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  31.76 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  36.52 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  31.08 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  34.45 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  36.75 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  36.13 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  36.43 
 
 
176 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  36.43 
 
 
176 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  35.29 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  35.66 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  35.29 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  32.2 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  32.2 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  35.29 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  38.55 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  31.68 
 
 
173 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  30.53 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  24.17 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  32.2 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  28.91 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  34.78 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  36.71 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  33.72 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  33.72 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  33.72 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  33.72 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  30.83 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  33.72 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  34.78 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  32.56 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2069  hypothetical protein  37.7 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.473334  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  32.56 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  34.02 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  40.58 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  24.83 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  30.11 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0873  hypothetical protein  36.36 
 
 
86 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  28.8 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  32.14 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  25.81 
 
 
162 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  32.99 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  29.37 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  24.81 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  24.17 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  25 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  30.95 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  28.79 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  31.76 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  30.95 
 
 
191 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  30.95 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  31 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2238  hypothetical protein  30 
 
 
128 aa  42.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000319661  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  26.67 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  26.88 
 
 
189 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  32.97 
 
 
142 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2273  hypothetical protein  36.21 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0784666  hitchhiker  0.00253392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  21.23 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  29.76 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  34.44 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  28.97 
 
 
142 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>