20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2069 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2069  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  222  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.473334  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  38.89 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  40.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  37.7 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  40.32 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  37.7 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  37.7 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  38.57 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  29.55 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  37.14 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  27.96 
 
 		 173 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  40.38 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  38.71 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  35.09 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  32.1 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  36.07 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  26.76 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4174  hypothetical protein  35.19 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  31.58 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  35.19 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>