31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0372 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  46.85 
 
 
138 aa  98.2  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  37.17 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  25 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  34.55 
 
 
152 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  34.41 
 
 
159 aa  58.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  34.29 
 
 
174 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  35.29 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  28.21 
 
 
140 aa  51.6  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  31.18 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  30.56 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  30.7 
 
 
161 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  28.36 
 
 
156 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  27.72 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  40.62 
 
 
151 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  40.62 
 
 
151 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  40.62 
 
 
151 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  40.62 
 
 
151 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  40.62 
 
 
151 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  35.96 
 
 
142 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  24.21 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  26.88 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  26.88 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  26.36 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  40.32 
 
 
151 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  31.52 
 
 
149 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  32.61 
 
 
149 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  26.88 
 
 
148 aa  41.6  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  35 
 
 
138 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  39.06 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>