23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2752 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  309  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  71.83 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  33.61 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  27.59 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  26.72 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  25.51 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  30.63 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  25.89 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  29.46 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  38.96 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  22.69 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  34.74 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  34.82 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  23.23 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  26.67 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  23.08 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  29.52 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  28.78 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>