12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0746 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0746  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  800    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.93 
 
 
1868 aa  206  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  24.55 
 
 
390 aa  100  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  22.02 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0945  ATPase  24.34 
 
 
364 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3566  hypothetical protein  26.14 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.941558  normal  0.0567741 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2550  hypothetical protein  28.99 
 
 
357 aa  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.358793  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  30.84 
 
 
377 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  24.15 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2856  hypothetical protein  35.71 
 
 
227 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  30.73 
 
 
371 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  25.4 
 
 
1362 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>