23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2078 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  810    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.89 
 
 		 1868 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0945  ATPase  26.49 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0746  hypothetical protein  24.55 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  23.38 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  27.23 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  23.93 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  22.77 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.335522 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  22.03 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  22.04 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  22.04 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  24.5 
 
 		 377 aa  53.1  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  21.29 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  20.83 
 
 		 361 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1788  hypothetical protein  29.63 
 
 		 132 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0169511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  22.13 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  18.84 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  28.57 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  20.95 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  20.99 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3946  hypothetical protein  23.32 
 
 		 915 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2550  hypothetical protein  21.23 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.358793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  24.38 
 
 		 359 aa  43.5  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>