27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4921 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  754    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  52.88 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  52.2 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  35.07 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  35.07 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  31.27 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  32.16 
 
 		 377 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  28.28 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  27.66 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  27.39 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  28.2 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  27.13 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  26.61 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  28.39 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  28.39 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  28.3 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  26.09 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  27.15 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  24.55 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  24.41 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  24.16 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  26.4 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  24.75 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  28.14 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  18.84 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  25.12 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  25.33 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>